Ханако, призрак с внеклассными историями

Среди учеников академии Камомэ ходят слухи о том, что Ханако-кун, один из Семи Школьных Чудес, получил помощницу. Ей стала первокурсница старшей школы Нэнэ Ясиро. Вместе Ханако и Ясиро расследуют различные аномалии, происходящие в школе, поддерживая баланс между миром людей и сверхъестественных существ.

В свободное от расследований время персонажи часто проводят вместе, участвуя в повседневных ситуациях с одноклассниками Ясиро. Они также взаимодействуют с призрачными сущностями, которые скрываются в стенах школы и невидимы для обычных людей. Эти контакты приводят к разным событиям, раскрывающим особенности как человеческих, так и потусторонних персонажей.