Маленькие проказники! Ещё раз

После первого проигранного бейсбольного матча команда Little Busters решает устроить вечеринку с блинами. С возвращения Кёсукэ Нацумэ прошло почти полсеместра. Рики Наоэ продолжает помогать как старым, так и новым членам команды справляться с их внутренними проблемами. В это время начинают происходить странные события, которые подводят Рин Нацумэ и Рики к разгадке тайны этого мира.

Рики и Рин не подозревают, что их открытие навсегда изменит мирную повседневную жизнь, созданную Little Busters. Второй сезон под названием Little Busters!: Refrain подводит итог историям персонажей, показывая, как они справляются со своими сожалениями и слабостями. Сюжет строится вокруг раскрытия главной тайны, которая меняет отношения между героями и их восприятие реальности.