Детектив Конан: На перекрёстках древней столицы

Маскированный самурай совершает убийства пяти мужчин в разных городах Японии - трёх в Токио, одного в Осаке и одного в Киото. Полиция устанавливает, что все жертвы были членами банды Гэндзиботару, специализировавшейся на краже буддийских статуй и артефактов. Члены банды использовали псевдонимы, основанные на именах слуг Минамото-но Ёсицунэ. Отсутствие явных мотивов и зацепок заводит расследование в тупик.

Киотский храм обращается за помощью к Когоро Мори после получения анонимного письма с зашифрованным посланием. Монахи просят расшифровать его, чтобы вернуть давно утраченную статую. Детектив Конан Эдогава объединяется с сыщиком Хэйдзи Хаттори для разгадки тайны. Хаттори использует знание Киото для поисков убийцы и одновременно пытается отыскать свою детскую любовь. По ходу расследования самурай убивает ещё одного члена банды, совершает несколько покушений на Хаттори и похищает его возлюбленную. Конан и Хаттори должны совместными усилиями раскрыть скрытые улики, чтобы остановить убийцу и спасти заложницу.