Детектив Конан: Квартал молчания

События разворачиваются в день открытия новой линии токийского метро Тото. Взрыв на поезде срывает церемонию, но губернатор Токио и другие пассажиры остаются в живых благодаря действиям Конана Эдогавы. Заинтересовавшись инцидентом, Конан изучает политическую биографию губернатора и выясняет, что тот был ответственен за снос деревни в Ниигате для строительства плотины Китаносава. Предполагая связь атаки с этим проектом, Конан отправляется в деревню вместе с Ран Мори, Когоро Мори, профессором Агасой, Соно Судзуки и Детективным клубом.

В деревне группа знакомится с местными жителями, ранее проживавшими в старом поселении до его сноса. Вскоре одного из этих жителей находят убитым. Конан приходит к выводу, что за обоими происшествиями стоит нечто более серьезное, чем кажется на первый взгляд. Он намерен выяснить истинные причины взрыва в метро и убийства в деревне, пока не произошли новые трагические события.